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遵义医科大学张磊教授等:亚甲基四氢叶酸脱氢酶2(MTHFD2)小分子抑制剂研究进展

引用本文:孙斌,张磊亚甲基四氢叶酸脱氢酶2MTHFD2)小分子抑制剂研究进展[J]. 化学试剂,202446(8)25-33.

DOI:10.13822/j.cnki.hxsj.2024.0096


2024.0096亚甲基四氢叶酸脱氢酶2( MTHFD2) 小分子抑制剂研究进展.pdf

背景介绍


为了维持增殖,肿瘤细胞依赖于一碳代谢来支持嘌呤和嘧啶核苷酸的合成。亚甲基四氢叶酸脱氢酶2MTHFD2)是参与线粒体叶酸一碳代谢的主要酶之一,其是一种线粒体双功能酶,具有脱氢酶和环水解酶活性。在癌症组织中,一些一碳代谢过程中的基因会出现高度的过表达,其中亚甲基四氢叶酸脱氢酶2MTHFD2)是人肿瘤中过表达最多的基因之一。但在生理情况下,MTHFD2只在胚胎发育的过程中广泛上调,而在成人组织中几乎不表达,这使得MTHFD2具有成为癌症治疗安全有效的潜在靶点


文章亮点

1.概述了一碳代谢酶MTHFD2与肿瘤之间的关系

2.总结了目前已文献报道的几类靶向MTHFD2小分子抑制剂,并根据抑制剂与靶蛋白的复合物晶体结构图对结合模式进行解析

3.MTHFD2抑制剂的进一步结构修饰和活性研究提供了思路


内容介绍

1  MTHFD2与肿瘤的关系

MTHFD2属于亚甲基四氢叶酸脱氢酶(MTHFD)家族,于1960年首次发现于Ehrlich腹水肿瘤细胞,其在叶酸代谢中以NADP+为氢受体催化亚甲基四氢叶酸生成甲酰基四氢叶酸并生成NADPH,在哺乳动物的胚胎发育中起到重要作用[18]

但近年来,MTHFD2的非酶功能逐渐被报道,其定位于细胞核中的DNA复制位点,在癌症的增殖过程中起到驱动作用[19]

2  MTHFD2小分子抑制剂

2.1  底物类似物抑制剂

2017年,Gustafsson[30]报道了第一种底物类似物MTHFD2抑制剂LY345899(化合物1,图1),并且揭示了MTHFD2与底物抑制剂、酶辅因子NAD+和无机磷酸盐配合物的第一个晶体结构。

MTHFD2与化合物1NAD+Pi配合物的X射线共晶结构显示,抑制剂化合物1结合在MTHFD2蛋白N-C-末端结构域之间的大裂缝中,蛋白质桥接在抑制剂上形成隧道(图2)。

2022年,Bonagas[31]采用底物引导的先导化合物优化策略,报道了具有高效力和选择性的MTHFD2抑制剂TH9619(化合物2,图3)。化合物2MTHFD2复合物的晶体结构如图4所示。

2.2  三环香豆素骨架抑制剂

2019年,Kawai[33]公开了一种新型具有三环香豆素骨架的选择性MTHFD2抑制剂DS44960156(化合物5,图5)。MTHFD2-化合物6复合物的X射线晶体结构如图6所示。

2.3  大环内酯酮羧酸抑制剂

天然产物一直是新药先导化合物的重要来源,但对其中许多活性天然产物来说,其作用机制(MoA)仍然未知[36,37]2017年,Fu[38]报道了一种天然产物Carolacton化合物21,图11)。

2.4  黄嘌呤衍生物变构抑制剂

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3  结论与展望

由于MTHFD2具有在肿瘤细胞中高表达、与肿瘤细胞生长及代谢增殖密切相关,对正常细胞毒性可能较低的特点,MTHFD2酶被认为是一个可靠的抗肿瘤药物研究的新靶点,引起很多学者的浓厚兴趣。目前,MTHFD2抑制剂开发仍处于进行时,化合物的优化空间较大,开发亲和力更强,选择性更好的化合物仍然是开发人员的重要工作。同时潜在适应症的选择,临床前验证体系的开发也是重要的研究方向。MTHFD2新型抑制剂有望在肿瘤新药开发、克服药物潜在毒副作用方面取得好的成果,具有重要的理论和实践意义